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MTHFR基因多态性(C667T)
1.甲氨蝶呤(MTX)是叶酸拮抗剂,能抑制亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的活性,研究发现MTHFR基因第677位碱基的C→T突变显著增加MTX的毒副作用。
2.5-FU为嘧啶类似物,MTHFR参与其代谢,研究结果表明,MTHFR基因第677位碱基的C→T突变可以导致酶活性显著下降,从而增加对5-FU的敏感性。
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TS基因多态性(2R/3R)
TS是DNA合成的关键酶,TS基因非编码区串联重复序列多态性可能导致酶活性或表达改变,从而导致患者对氟尿嘧啶类药物的敏感性发生变化。TS的5~UTR基因多态性分为2R/2R(2R纯合子)、3R/3R(3R纯合子)和2R/3R(2R/3R杂合子)三类,其中3R/3R型酶活性增加,导致5-FU在体内代谢加快,化疗效果降低。
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GSTP1基因多态性(I105V)
谷胱甘肽S转移酶P1(GSTP1)是人体内重要的II相代谢酶,主要参与解毒反应,降低化疗毒副作用。GSTP1基因第105密码子由原来的异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val)使酶活性显著降低,导致机体对某些肿瘤化疗药物的解毒能力下降,化疗药物在肿瘤细胞内滞留的时间增长,疗效增强,因此含Val的患者对于以铂类为基础的化疗有效率高于不含Val患者。
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GSTT1基因多态性
谷胱甘肽S转移酶基因是主要的II相代谢酶,主要参与解毒反应,降低化疗毒副作用。其多态性影响酶活性,导致肿瘤细胞对化疗药物敏感性发生变化,临床结果显示GSTT1基因缺失型患者接受以铂类为基础的化疗方案时治疗疗效优于未缺失型患者。
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XPD基因多态性(A751C)
XPD(着色性干皮病基因)在DNA损伤修复中起着重要作用,XPD基因多态性导致其酶活改变而影响铂类药物的化疗效果,其中A751C位点由赖氨酸变为谷氨酰胺,使患者对奥沙利铂的治疗效果产生影响,C/C型病人敏感性更好,疾病缓解率优于C/A和A/A型病人。
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XRCC1基因多态性(R399Q)
XRCC1是DNA碱基切除修复中的关键基因,该基因编码区单核苷酸多态性与铂类药物敏感性密切相关。其中XRCC1的R399Q位点GG型患者对铂类药物的有效性是AG和AA型的2.7倍,患者总生存期明显延长。因此使用铂类药物前检测XRCC1基因多态性,可预测铂类药物的治疗效果,提高生存率。
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ERCC1基因多态性(C118T)
ERCC1基因多态性可改变基因修复能力,其ERCC1118密码子C→T的改变可引起患者对钼类药物敏感性下降,化疗疗效降低。
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MGMT基因启动子甲基化
MGMT在脑胶质瘤组织中表达与肿瘤细胞对亚硝脲类药物的耐药密切相关,并影响肿瘤的化疗效果和病人的预后。在许多肿瘤中发现MGMT启动子区过甲基化而导致MGMT基因的转录失活,表达量下降,在脑胶质瘤的研究发现,MGMT甲基化导致的基因沉默与替莫唑胺疗效相关,MGMT基因启动甲基化程度越高,使用替莫唑胺药物疗效越好。
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VEGF基因表达水平
血管内皮生长因子,用于预测贝伐单抗在肠癌中的疗效。VEGF高表达者使用贝伐单抗疗效较好。
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TS基因表达水平
在结直肠癌、肺癌、乳腺癌、头颈鳞状细胞癌等多种肿瘤的临床研究中,都显示TS基因mRNA表达水平与5-FU疗效密切相关。临床研究结果表明:TSmRNA表达水平低的肿瘤患者接受氟类化疗的效果较好,中位生存期较长;反之,TS高表达的患者对氟类疗效较差。最新的研究也发现,新型抗叶酸药物培美曲赛的疗效与TS基因的mRNA表达水平呈负相关。
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β-tubulinIII基因表达水平
β-tubulin III基因mRNA表达水平与抗微管类化疗药物的疗效密切相关。β-tubulin III基因表达水平低的肿瘤患者接受紫杉醇类或长春碱类化疗药物的效果较好,中位生存期较长;反之,β-tubulin III高表达的患者的抗微管类化疗药物疗效较差。
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RRMl基因表达水平
临床研究显示,RRMl基因MRNA表达水平低的肺癌患者对吉西他滨敏感性相对较高,药物疗效较好,中位生存期延长。因此,美国NCCN非小细胞肺癌临床治疗指南明确指出,RRMl低水平表达的肺癌患者对吉西他滨敏感性相对较高,药物疗效较好;但是,肿瘤组织中RRMl呈高表达时,患者预后却相对较好,而且与治疗无关。
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PTEN基因表达水平
用于预测爱必妥(cetuximab)在转移性结肠癌(mCRC)患者中的疗效。PTEN基因低表达的患者,爱必妥治疗有效率低。
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BRCA1基因表达水平
1.铂类化合物通过广泛结合DNA、抑制细胞分裂发挥抗肿瘤作用。因此,具有DNA损伤修复功能的BRCA1基因高表达会降低铂类药物的疗效。临床研究表明,铂类药物的疗效与肿瘤组织中BRCA1基因mRNA表达水平密切相关,BRCA1基因表达水平低的患者对铂类药物敏感;
2.抗微管类化疗药作用于细胞微管,通过影响纺锤体形成从而抑制细胞有丝分裂,主要包括紫杉醇、长春碱和长春瑞滨等。而BRCA1基因高表达对中心体复制的负性调节作用将与抗微管药物协同作用,共同影响肿瘤细胞的分裂。抗微管药物疗效与肿瘤组织中BRCA1基因mRNA表达水平密切相关,即BRCA1基因表达水平高的患者对抗微管类药物敏感。
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ERCC1基因表达水平
ERCC1参与顺铂等化疗药物的耐药发生,其表达水平与多种肿瘤铂类化疗疗效和生存期呈负相关,即表达水平低的患者对铂类药物敏感,表达水平高的患者表现耐药。因此,美国NCCN非小细胞肺癌临床治疗指南明确指出,ERCC1基因mRNA表达呈高水平时,提示患者对铂类化疗药物耐药。
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MMR蛋白(mlH1、MSH2、MSH6、PMS2)
1.预后方面:MMR缺陷患者预后相对较好,肿痛具有复发率低、缓解期长、低转移和存活率较高的特性。2.用药方面:II期MMR缺陷的结肠癌患者对5-FU的治疗效果不明显,不适合5-FU治疗。
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MSI微卫星不稳定
微卫星不稳定性(MSI)是指DNA甲基化或基因突变致错配修复(MMR)基因缺失,从而导致微卫星重复序列长度的改变。
1.预后方面:MSI-H的结直肠癌多位于近端结肠,易伴发肠内及肠外其他器官多发性肿瘤,预后较好。
2.用药方面:对于MSI-H的II期结直肠癌患者不能从5-FU的辅助化疗中获益。
3.诊断方面:MSI检测可用于诊断Lynch综合征(HNPCC)。
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MSI微卫星+MMR蛋白
1.预后方面:MMR缺陷或者MSI-H患者预后相对较好。
2.用药方面:II期结直肠癌,有高危因素,需要辅助化疗患者。有条件者建议检测组织标本MMR或MSI,如为dMMR或MSI-H,不推荐氟尿嘧啶类药物的单药辅助化疗。
3.诊断方面:MSI及MMR蛋白检测可用于诊断Lynch综合征(HNPCC)。
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PIK3CA基因突变检测(1047位点)
1.研究发现,有PIK3CA突变的肿瘤细胞使用针对EGFR或ERBB2通路的靶向药物药物拉帕替尼(Lapatinib)会产生耐药性。
2.此外还有研究表明,选择性针对HER2的靶向治疗药物赫赛汀(Herceptin)对PIK3CA基因突变的人群疗效欠佳,因此,PIK3CA基因检测结果也是乳腺癌患者合理用药的参考依据。
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PIK3CA基因突变检测(545位点)
1.研究发现,有PIK3CA突变的肿瘤细胞使用针对EGFR或ERBB2通路的靶向药物药物拉帕替尼(Lapatinib)会产生耐药性。
2.此外还有研究表明,选择性针对HER2的靶向治疗药物赫赛汀(Herceptin)对PIK3CA基因突变的人群疗效欠佳,因此,PIK3CA基因检测结果也是乳腺癌患者合理用药的参考依据。
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